Suivi des variants du SARS-CoV-2

Tous les virus, y compris le SARS-CoV-2, le virus responsable de la COVID-19, mutent avec le temps. La plupart des mutations n’ont que peu ou pas d’incidence sur les propriétés du virus. Cependant, certaines mutations peuvent affecter les propriétés du virus et influer, par exemple, sur la facilité avec laquelle il se propage, la gravité de la maladie qu’il entraîne ou l’efficacité des vaccins, des médicaments, des outils de diagnostic ou des autres mesures sociales et de santé publique.

Le groupe de travail de l’OMS sur l’évolution du virus a été créé en juin 2020 afin d’examiner spécifiquement les variants du SARS-CoV-2, leur phénotype et leurs répercussions sur les mesures de lutte. Il a pris ensuite le nom de Groupe consultatif technique sur l'évolution du virus SARS-CoV-2 (en anglais). L’apparition, fin 2020, de variants qui présentaient un risque accru pour la santé publique mondiale a conduit l’OMS à caractériser certains d’eux comme des variants à suivre et d’autres comme des variants préoccupants, afin de hiérarchiser les activités de surveillance et de recherche au niveau mondial et de guider la riposte à la pandémie de COVID-19. Depuis mai 2021, l’OMS attribue aux principaux variants des dénominations simples, faciles à prononcer.

Des progrès considérables ont été accomplis dans la mise en place puis le renforcement d’un système mondial pour détecter les signes d’éventuels variants à suivre ou variants préoccupants et pour évaluer rapidement le risque que les variants du SARS-CoV-2 présentent pour la santé publique. Plus précisément, en 2024, l’OMS a lancé CoViNet, un réseau consacré aux coronavirus (en anglais), dans le but de faciliter la détection rapide et précise des coronavirus et le suivi des variants, ainsi que de coordonner l’évaluation des risques. Il demeure essentiel de maintenir ces systèmes et de partager les données, conformément aux principes de bonne pratique et en temps utile, car les niveaux de circulation du virus restent élevés partout dans le monde. Tout en surveillant la circulation du SARS-CoV-2 à l’échelle mondiale, il reste aussi indispensable de surveiller sa propagation au sein des populations animales et les individus chroniquement infectés, autant d'aspects cruciaux de la stratégie mondiale visant à limiter l’apparition de mutations qui ont des répercussions négatives sur la santé publique. En mars 2023, l’OMS a mis à jour son système de suivi et ses définitions de travail pour les variants préoccupants, les variants à suivre et les variants sous surveillance. Ces informations sont disponibles ici (en anglais). Les définitions de travail précédentes peuvent être consultées ici (en anglais).

Variants préoccupants (VOC) actuellement en circulation : mise à jour du 15 mars 2023

Note : Pour mieux rendre compte de la situation actuelle des variants, caractérisée par la prédominance des lignées descendantes d’Omicron, l’OMS a mis à jour son système de suivi des variants préoccupants (VOC) et des variants à suivre (VOI) du SARS-CoV-2 le 15 mars 2023.

Variants à suivre (VOI) actuellement en circulation : mise à jour du 9 février 2024

Lignée PANGOClade NextstrainCaractéristiques génétiquesPremiers échantillons répertoriésDate de désignation et évaluation des risques
XBB.1.523A
Recombinant des sous-lignées BA.2.10.1 et BA.2.75, tels que BJ.1 et BM.1.1.1, avec un point de rupture sur S1.

XBB.1 + S:F486P (profil génétique Spike similaire à celui du variant XBB.1.9.1)

21/10/2022
11/01/2023



XBB.1.1623B

Recombinant des sous-lignées BA.2.10.1 et BA.2.75, c’est-à-dire BJ.1 et BM.1.1.1

XBB.1 + S:E180V, S:K478R and S:F486P
09/01/2023

17/04/2023

Évaluation rapide du risque pour le variant XBB.1.16, 17 avril 2023 (en anglais)

Évaluation du risque mise à jour pour le variant XBB.1.16, 5 juin 2023 (en anglais)

EG.5Non assigné

 

XBB.1.9.2 + S:F456L

Inclut EG.5.1: EG.5 + S:Q52H

HK.3: EG.5 + S:Q52H, S:L455F

HV.1: EG.5 + S:Q52H, S:F157L, S:L452R

17/02/2023

09/08/2023

Évaluation rapide du risque pour le variant EG.5, 9 août 2023 (en anglais)

Mise à jour de l'évaluation rapide du risque pour le variant EG.5, 21 septembre 2023 (en anglais)

Mise à jour de l'évaluation rapide du risque pour le variant EG.5, 21 novembre 2023 (en anglais)

BA.2.86$Non assigné

 

Mutations relatives à BA.2

Inclut JN.1: BA.2.86 + S:L455S

24/07/2023

21/11/2023

Évaluation initiale du risque pour BA.2.86, 21 novembre 2023 (en anglais)

 

JN.1

 

Non assigné

BA.2.86

25/08/2023

18/12/2023

Évaluation initiale du risque pour JN.1, 18 décembre 2023 (en anglais)

Mise à jour de l'évaluation initiale du risque pour JN.1, 9 février 2024 (en anglais)

$À l'exclusion de la sous-lignée BA.2.86 listée ici en tant que variant à suivre (VOI).

Variants sous surveillance (VUM) actuellement en circulation (au 10 avril 2024)