Cancer : Roche veut devenir incontournable dans le choix des traitements

En matière de « Big data », la stratégie du groupe suisse Roche se distingue de celle de ses concurrents. Pas d'annonce spectaculaire d'accord avec Google qui fasse la une des journaux. Ce n'est pas le genre du très discret groupe bâlois mais, fort de son talent de dénicheur de pépites, il a acheté, en juin dernier, pour 2,4 milliards de dollars supplémentaires, le solde de la société américaine Foundation Medicine dont il détenait déjà, depuis trois ans, 56 %, acquis pour un milliard de dollars. La combinaison des actifs et du savoir-faire de cette entreprise avec ceux de la start up américaine, Flatiron reprise, elle, en 2016, pour 175 millions de dollars, devrait permettre à Roche de disposer de l'outil idéal pour mettre en oeuvre sa stratégie de médecine personnalisée dans le domaine du cancer. Fidèle à la méthode qui lui a si bien réussi avec Genentech, le groupe suisse entend laisser à Foundation Medicine une très grande autonomie et notamment la possibilité de continuer à travailler avec des concurrents. Une position qui peut sembler paradoxale mais qui est en fait indispensable pour permettre à Roche d'atteindre ses objectifs. 

324 mutations

« Foundation Medicine n'est pas une société de diagnostic » comme tient à le préciser Mélanie Nallicheri, sa directrice générale. En tous cas au sens habituel du terme. L'entreprise dispose en effet d'une base de données génomiques issue de 220.000 patients à partir de laquelle elle a développé un test, reconnu par la FDA, permettant d'identifier 324 mutations et deux biomarqueurs représentatifs des altérations pertinentes dans une tumeur cancéreuse. Le médecin envoie à Foundation Medicine un échantillon de biopsie préparé grâce à au kit qu'elle fournit. La société le teste dans son laboratoire central et grâce à ses logiciels fait un état de l'art, peut indiquer le traitement le plus approprié s'il existe, ou toutes les options possibles s'il n'y pas de réponse simple. Une aide précieuse pour les cancérologues, confrontés aujourd'hui à l'explosion des combinaisons de molécules.

Un standard

Foundation Medicine propose donc aux laboratoires pharmaceutiques, soit un accès à ses données pour les aider à sélectionner les patients pour leurs essais cliniques , soit un accès à sa plateforme de diagnostic pour tester leurs propres échantillons. « Cette deuxième option contribue alors à alimenter notre base de données » explique Melanie Nallicheri. « D'où l'intérêt pour Roche que d'autres que lui travaillent avec sa filiale, conclut Josh Lauer, directeur du développement pour la médecine personnalisée chez Roche, si nous voulons que notre test devienne le standard pour le choix du traitement ». En effet, comme l'explique un cancérologue, « faire du séquençage à haut débit et constituer de grandes bases de données, c'est facile aujourd'hui mais c'est la qualité des données et des logiciels qui est déterminante et ça ce n'est pas à la portée de n'importe qui ». Et c'est là que Flatiron apporte une plus-value. Cette société dispose en effet, d'une base de données cliniques, c'est qui permettent de connaitre les performances des traitements en vie réelle. Sachant qu'une partie des patients sont commun aux bases des deux entreprises, on peut valider si le traitement préconisé donne de bons résultats. La boucle est ainsi bouclée.